Das Museum befindet sich innerhalb der archäologischen Stätte und beherbergt Exponate der antiken Siedlung und Nekropole von Orthi Petra. Die ständige Sammlung präsentiert Kunst- und Alltagsgegenstände aus prähistorischer, geometrischer, archaischer, klassischer, hellenistischer, römischer und byzantinischer Zeit mit modernen Ausstellungs- und Technologiemitteln.

Der erste der drei Räume präsentiert Objekte, die aus Gebieten außerhalb Kretas importiert wurden und Aspekte des öffentlichen und privaten Lebens in Eleftherna zeigen. Der zweite Raum befasst sich mit dem religiösen und religiösen Leben der Siedlung von der frühen Eisenzeit bis zur byzantinischen Zeit. Der dritte Raum enthüllt beeindruckende Geschenke und Bestattungspraktiken aus der Nekropole von Orthi Petra.