Il paese di Kaloi Limenes si trova a est del promontorio di Lithino, a sud della catena montuosa degli Asterousia.

Secondo gli Atti degli Apostoli (27,8), l’apostolo Paolo, in viaggio verso Roma per essere processato, fu costretto ad attraccare a Creta, a Kaloi Limenes, a causa dei forti venti. La presenza dell’apostolo Paolo condizionò la diffusione del Cristianesimo e incentivò la costruzione di basiliche, in epoca paleocristiana, nel sud di Creta e in particolare nell’area degli Asterousia.

Nel 1911 su un colle a sud del porto moderno, sul sito di una più antica basilica, fu costruita una piccola chiesa dedicata alla memoria dell’apostolo Paolo; accanto ad essa si trova una grotta in cui, secondo la tradizione, soggiornò l’Apostolo delle Nazioni.