Die Siedlung Kali Limenes liegt östlich des Kaps Lithino, südlich von Asterousia.

Nach dem Text der Apostelgeschichte (27,8) passierte der Apostel Paulus auf seinem Transport nach Rom um dort gerichtet zu werden, die Südküste Kretas und landete aufgrund starker Winde im sicheren Ankerplatz der Kali Limenes (Guten Häfen) . Die Anwesenheit von St. Paul ist mit der Ausbreitung des Christentums und der Errichtung von Basiliken während der ersten christlichen Zeit in Süd-Kreta und insbesondere in Asterousia, verbunden.

Im Jahr 1911 wurde an der Stelle einer alten Basilika auf einem Hügel südlich des modernen Hafens eine kleine Kirche zum Gedenken an St. Paul errichtet. Neben dem Tempel befindet sich eine Höhle, in der sich der Überlieferung nach der Apostel aufgehalten hat.