La chiesa si trova a Mesa Mouliana, a ovest del Geoparco di Sitia.
A causa delle numerose fasi di costruzione, la data di costruzione della chiesa resta incerta. La prima chiesa fu dedicata a San Giovanni Teologo e, probabilmente, risale al periodo medio-bizantino, successivamente la chiesa fu dotata di tre navate, di cui le due più nuove sono state dedicate alla Madonna e alla Santissima Trinità. Un’ulteriore aggiunta, in epoca veneziana, è la navata meridionale dedicata a San Charalambos. La chiesa fu più volte ristrutturata nell’Ottocento con l’aggiunta della navata nord e l’ampliamento di quelle occidentali.
Parte degli affreschi, che raffigurano gerarchi della Chiesa Ortodossa del XIV secolo, sono conservati nella nicchia del presbiterio.