Ο ναός βρίσκεται πάνω στο κεντρικό μονοπάτι που διασχίζει το Φαράγγι της Σαμαριάς, 4 χλμ από την είσοδο του. Χτίστηκε τον 18ο αιώνα πάνω στη θέση αρχαίου υπαίθριου ιερού, που έφεραν στο φως οι ανασκαφικές εργασίες. Η άσκηση θρησκευτικών πρακτικών στη φύση υπήρξε ιδιαίτερα διαδεδομένη στην Κρήτη ήδη από τους μινωικούς χρόνους. Η διαχρονική χρήση του ιερού μαρτυρείται από αναθήματα όπως τα χάλκινα νομίσματα, τα αγγεία πόσεως και τα λυχνάρια ρωμαϊκών χρόνων με ανάγλυφες παραστάσεις. Η φυσική διαμόρφωση του βράχου ευνόησε την κατασκευή εδράνου στο σημείο της φυσικής κοιλότητας, για την απόθεση αναθημάτων, όπως πήλινα αγγεία και ειδώλια, μικρές αναθηματικές χάλκινες και σιδερένιες αιχμές βελών και δοράτων. Μικρή εστία με υπολείμματα στάχτης και οστών ζώων υποδηλώνει χώρο θυσίας δίπλα στον βράχο.