Ο ναός βρίσκεται στην αρχή του φαραγγιού Μάρτσαλο που αναπτύσσεται παράλληλα με το Αγιοφάραγγο και μαζί σχηματίζουν την κοιλάδα των ερημιτών. Πρόκειται για σπηλαιώδη ναό κωνικού σχήματος που λαξεύτηκε στο βράχο μαζί με τα κελιά. Σήμερα σώζονται τα κελιά των μοναχών Παρθενίου και Ευμενίου, ανακαινιστών της Μονής Κουδουμά στα τέλη του 19ου αιώνα. Ο ναός είναι αφιερωμένος στον Ευαγγελισμό της Θεοτόκου σύμφωνα με την εικόνα που βρέθηκε εντός του, όταν ανακαλύφθηκε τυχαία από βοσκούς στις αρχές του 20ου αιώνα. Από τη θολωτή μορφή του ναού εκτιμάται ότι μπορεί να χτίστηκε στη θέση μινωικού τάφου.